Una causa rara que puede presentarse en uno de cada 22.000 recién nacidos vivos, pero que en una gran ciudad puede llegar a unos cientos de pacientes, y generalmente no diagnosticada hasta tarde, es la fructosemia o intolerancia congénita a la fructosa.

Aparece en forma de vómitos y en ocasiones mal estado general, tras la ingesta de fruta conteniendo los azúcares fructosa y sacarosa, que el paciente no puede metabolizar por falta del enzima fructosa- fosfo aldolasa; los vómitos suelen aparecer de inmediato, tras la ingesta de fruta o líquido con azúcar. Si el paciente sigue tomando alimentos con fructosa o sacarosa, presentará una interrupción de la curva de peso, talla, hipoglicemia (bajadas de azúcar) más o menos pronunciadas y daño hepático, renal y cerebral.

Una causa más benigna de no aceptación de la fruta es la alergia a la fruta, que puede cursar con rechazo de la fruta, y también vómitos, pero que, aparte de reacciones agudas por alergia IgE mediada alimentaria, no revista la gravedad de la fructosemia.

La palabra alergia significa "respuesta anómala".

En realidad no es una enfermedad sino una característica de algunas personas que producen un exceso del anticuerpo IgE que reacciona con diversas substancias del entorno como alimentos, polvo, pólenes, ácaros.etc...que induce una alteración de unas células, degranulación de mastocitos con liberación de una serie de substancias serotonina, histamina, leukotrienes, citokinas..etc..que provocan una reacción inmediata o casi inmediata, más frecuentemente con uno o más de los síntomas siguientes: manchas rojas, abultadas por la piel ("máculo pápulas eritematosas"), vómitos inmediatos, diarrea profusa, algias de abdomen, cefalea, edema de glotis con dificultad respiratoria, descenso de la tensión arterial y en ocasiones shock hipovolémico.

Hay otro tipo de alergia no mediada por IgE, inducida por la acción de unas células T específicas y liberación de unas substancias sobre todo del TNF alfa, que induce síndromes mal absortivos, es decir procesos de mala absorción intestinal, como diarrea crónica más o menos pastosa, con aumento de la pérdida de grasa por heces ( aumento de la "esteatorrea"); la sintomatología ante este tipo de alergia no es de aparición inmediata sino puede manifestarse tras varios días o incluso semanas tras la ingesta de los alimentos agresivos, generalmente la leche de vaca, es decir tras la ingesta de cualquier leche de inicio en polvo para lactantes. En ocasiones los síntomas son de tipo "cólico del recién nacido o lactante": llanto intenso, fuerte, continuo que puede durar horas

Se suele dar algún tipo de alergia en un 3 a 4 % de individuos, como consecuencia de la interacción entre un individuo susceptible genéticamente y factores ambientales.